Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTDSS1P48651 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms