Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms