Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms