Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDF5P43026 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDF5P43026 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms