Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms