Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARGP37231 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPARGP37231 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGP37231 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGP37231 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGP37231 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGP37231 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGP37231 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGP37231 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGP37231 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGP37231 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGP37231 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGP37231 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGP37231 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGP37231 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGP37231 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGP37231 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGP37231 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGP37231 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGP37231 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGP37231 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGP37231 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGP37231 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGP37231 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGP37231 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGP37231 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGP37231 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGP37231 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGP37231 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGP37231 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGP37231 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGP37231 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGP37231 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms