Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHI3L1P36222 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms