Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms