Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJA4P35212 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GJA4P35212 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms