Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms