Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNGA1P29973 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms