Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2E1P29083 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms