Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA1P25391 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA1P25391 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA1P25391 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA1P25391 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA1P25391 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA1P25391 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA1P25391 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA1P25391 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA1P25391 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA1P25391 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA1P25391 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA1P25391 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA1P25391 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA1P25391 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA1P25391 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA1P25391 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA1P25391 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA1P25391 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA1P25391 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA1P25391 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA1P25391 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA1P25391 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA1P25391 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA1P25391 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA1P25391 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA1P25391 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMA1P25391 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms