Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODC1P11926 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODC1P11926 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODC1P11926 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODC1P11926 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODC1P11926 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODC1P11926 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODC1P11926 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODC1P11926 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODC1P11926 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODC1P11926 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODC1P11926 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODC1P11926 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODC1P11926 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODC1P11926 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODC1P11926 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODC1P11926 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODC1P11926 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODC1P11926 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODC1P11926 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODC1P11926 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ODC1P11926 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODC1P11926 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODC1P11926 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODC1P11926 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODC1P11926 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODC1P11926 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODC1P11926 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODC1P11926 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODC1P11926 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODC1P11926 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODC1P11926 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODC1P11926 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODC1P11926 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODC1P11926 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODC1P11926 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODC1P11926 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODC1P11926 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODC1P11926 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms