Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHGAP10645 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHGAP10645 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHGAP10645 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHGAP10645 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHGAP10645 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHGAP10645 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHGAP10645 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHGAP10645 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHGAP10645 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHGAP10645 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHGAP10645 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHGAP10645 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHGAP10645 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHGAP10645 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHGAP10645 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHGAP10645 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHGAP10645 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHGAP10645 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHGAP10645 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHGAP10645 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHGAP10645 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHGAP10645 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHGAP10645 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHGAP10645 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHGAP10645 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHGAP10645 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHGAP10645 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHGAP10645 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHGAP10645 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHGAP10645 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHGAP10645 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHGAP10645 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHGAP10645 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHGAP10645 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHGAP10645 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHGAP10645 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHGAP10645 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHGAP10645 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHGAP10645 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHGAP10645 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHGAP10645 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHGAP10645 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHGAP10645 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHGAP10645 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHGAP10645 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHGAP10645 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CHGAP10645 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHGAP10645 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHGAP10645 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHGAP10645 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHGAP10645 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHGAP10645 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHGAP10645 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHGAP10645 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHGAP10645 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHGAP10645 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHGAP10645 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHGAP10645 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHGAP10645 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHGAP10645 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHGAP10645 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHGAP10645 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHGAP10645 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHGAP10645 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHGAP10645 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHGAP10645 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHGAP10645 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHGAP10645 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHGAP10645 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHGAP10645 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHGAP10645 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHGAP10645 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHGAP10645 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHGAP10645 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHGAP10645 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHGAP10645 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHGAP10645 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHGAP10645 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHGAP10645 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHGAP10645 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHGAP10645 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHGAP10645 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHGAP10645 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHGAP10645 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHGAP10645 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHGAP10645 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHGAP10645 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHGAP10645 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHGAP10645 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHGAP10645 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHGAP10645 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHGAP10645 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHGAP10645 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHGAP10645 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHGAP10645 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHGAP10645 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHGAP10645 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHGAP10645 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHGAP10645 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1218.2 ms