Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

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Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRFP10586 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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