Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI3P10071 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
GLI3P10071 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI3P10071 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI3P10071 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI3P10071 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI3P10071 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI3P10071 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI3P10071 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI3P10071 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI3P10071 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI3P10071 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI3P10071 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI3P10071 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI3P10071 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI3P10071 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI3P10071 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI3P10071 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI3P10071 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI3P10071 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI3P10071 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI3P10071 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI3P10071 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI3P10071 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI3P10071 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI3P10071 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI3P10071 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI3P10071 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI3P10071 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI3P10071 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI3P10071 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI3P10071 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI3P10071 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI3P10071 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms