Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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PKHD1P08F94 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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PKHD1P08F94 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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PKHD1P08F94 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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PKHD1P08F94 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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PKHD1P08F94 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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