Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBP07199 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBP07199 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBP07199 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBP07199 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBP07199 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBP07199 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBP07199 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBP07199 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBP07199 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBP07199 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBP07199 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBP07199 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBP07199 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBP07199 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBP07199 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBP07199 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBP07199 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBP07199 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBP07199 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBP07199 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBP07199 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBP07199 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBP07199 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBP07199 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBP07199 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBP07199 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBP07199 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBP07199 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBP07199 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBP07199 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBP07199 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPBP07199 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPBP07199 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPBP07199 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPBP07199 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPBP07199 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPBP07199 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPBP07199 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPBP07199 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPBP07199 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPBP07199 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPBP07199 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPBP07199 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPBP07199 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPBP07199 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPBP07199 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPBP07199 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPBP07199 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPBP07199 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPBP07199 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPBP07199 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPBP07199 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPBP07199 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPBP07199 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPBP07199 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPBP07199 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPBP07199 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPBP07199 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPBP07199 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPBP07199 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPBP07199 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPBP07199 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPBP07199 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPBP07199 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms