Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POP4O95707 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POP4O95707 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms