Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms