Protein–RNA interactions for Protein: O43490

PROM1, Prominin-1, humanhuman

Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM1O43490 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROM1O43490 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROM1O43490 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROM1O43490 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROM1O43490 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROM1O43490 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PROM1O43490 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROM1O43490 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROM1O43490 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROM1O43490 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROM1O43490 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROM1O43490 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROM1O43490 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PROM1O43490 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROM1O43490 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROM1O43490 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROM1O43490 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROM1O43490 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PROM1O43490 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PROM1O43490 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PROM1O43490 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PROM1O43490 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PROM1O43490 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PROM1O43490 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PROM1O43490 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PROM1O43490 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PROM1O43490 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PROM1O43490 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PROM1O43490 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PROM1O43490 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PROM1O43490 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PROM1O43490 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PROM1O43490 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PROM1O43490 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PROM1O43490 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PROM1O43490 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PROM1O43490 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PROM1O43490 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PROM1O43490 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms