Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCAO15360 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCAO15360 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCAO15360 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCAO15360 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCAO15360 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCAO15360 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCAO15360 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCAO15360 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCAO15360 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCAO15360 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCAO15360 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCAO15360 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCAO15360 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCAO15360 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCAO15360 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCAO15360 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCAO15360 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCAO15360 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCAO15360 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCAO15360 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCAO15360 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCAO15360 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCAO15360 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCAO15360 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCAO15360 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCAO15360 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCAO15360 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCAO15360 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCAO15360 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCAO15360 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCAO15360 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCAO15360 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCAO15360 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCAO15360 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCAO15360 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCAO15360 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCAO15360 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCAO15360 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCAO15360 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCAO15360 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCAO15360 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCAO15360 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCAO15360 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCAO15360 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCAO15360 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCAO15360 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCAO15360 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCAO15360 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCAO15360 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCAO15360 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCAO15360 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCAO15360 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCAO15360 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCAO15360 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCAO15360 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCAO15360 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCAO15360 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCAO15360 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCAO15360 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCAO15360 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCAO15360 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCAO15360 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCAO15360 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCAO15360 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCAO15360 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCAO15360 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCAO15360 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCAO15360 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCAO15360 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCAO15360 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCAO15360 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCAO15360 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCAO15360 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCAO15360 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCAO15360 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCAO15360 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCAO15360 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCAO15360 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCAO15360 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCAO15360 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCAO15360 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCAO15360 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCAO15360 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCAO15360 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCAO15360 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCAO15360 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCAO15360 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCAO15360 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCAO15360 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCAO15360 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCAO15360 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCAO15360 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCAO15360 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCAO15360 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCAO15360 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCAO15360 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCAO15360 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCAO15360 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCAO15360 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms