Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
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