Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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