Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms