Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms