Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

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Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRRM5B3KS81 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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