Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RGPD3A6NKT7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms