Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms