Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIPSLA2A3N6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms