Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms