Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms