Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms