Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms