Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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SH3BP4Q9P0V3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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