Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms