Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLMPQ9H6B4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms