Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LNPKQ9C0E8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms