Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms