Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

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Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP3Q9BZ76 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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