Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms