Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC023050.4-201ENST00000538830 1380 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 FXR1-220ENST00000491062 1768 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTMA-201ENST00000341369 1212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PACRG-AS3-201ENST00000419182 1131 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPCS1-202ENST00000423431 822 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC138392.1-201ENST00000427577 921 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMX3-202ENST00000443099 913 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z97198.1-201ENST00000452366 658 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 HLTF-AS1-201ENST00000492461 415 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001099.1-201ENST00000579385 855 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC106733.1-201ENST00000624476 1038 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms