Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms