Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL25A1Q9BXS0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms