Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWU1

CDK19, Cyclin-dependent kinase 19, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK19Q9BWU1 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK19Q9BWU1 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK19Q9BWU1 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK19Q9BWU1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK19Q9BWU1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK19Q9BWU1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK19Q9BWU1 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK19Q9BWU1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK19Q9BWU1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK19Q9BWU1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK19Q9BWU1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK19Q9BWU1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK19Q9BWU1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK19Q9BWU1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK19Q9BWU1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK19Q9BWU1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK19Q9BWU1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK19Q9BWU1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK19Q9BWU1 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK19Q9BWU1 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK19Q9BWU1 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK19Q9BWU1 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK19Q9BWU1 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK19Q9BWU1 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK19Q9BWU1 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK19Q9BWU1 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK19Q9BWU1 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK19Q9BWU1 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK19Q9BWU1 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK19Q9BWU1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK19Q9BWU1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK19Q9BWU1 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK19Q9BWU1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms