Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPIFA3Q9BQP9 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms