Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms