Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLRP3Q96P20 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms