Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms